基因型鑑定服務

服務說明

1. 提供相關實驗內容諮詢、Primer設計、客製化實驗規劃等等，主要使用儀器為Illumina BeadXpress Reader，分析方式為GoldenGate。

2. 使用者可選擇提供Sequence, RS Number, Region, Gene 等資訊，接著由 Illumina ADT（Assay Design Tool）軟體設計實驗套組，並分析每個SNP位點之成功率，使用者可從中挑選出相容性最好的組合進行實驗。

3. 可彈性選擇欲分析之SNP數量，48 plex, 96 plex, 144 plex, 192 plex以及384 plex，最高可同時於一個反應內偵測 384-plex 位點。

4. 最高產量一個星期可完成480 sample x 384 plex。

5. 採用標準化之實驗及分析流程。GoldenGate在主要步驟均有control的設計，方便實驗結束後追蹤整體實驗狀況。

6. 客製化實驗規劃，GoldenGate所使用之OPA試劑和Bead Plate為每次實驗所個別設計訂製。

7. 核心實驗室環境區分出Pre-PCR room 以及Post-PCR room，避免PCR contamination產生而影響其他的實驗結果。

8. 實驗室將使用GenomeStudio 軟體分析實驗結果並提供分析報告給使用者。

9. 實驗說明：
a. GoldenGate利用PCR反應為基礎，特色是搭配 VeraCode數位編碼技術，與DNA雜合之玻璃珠（帶有獨立編碼）經過雷射光激發後，顯現出特殊的條碼成像，藉此可快速且有 效地區分不同的基因型。

b. VeraCode技術需搭配本實驗室之雙色螢光偵測系統BeadXpress。

c. 使用genomic DNA為樣本（濃度：50 ng/uL），每次反應需 250 ng。

d. GoldenGate 基因型鑑定服務，依據plex數量不同主要有五種形式︰
48-plex, 96-plex, 144-plex, 192-plex and 384-plex，multiplex 同時在一個反應中進行，最少接受480 samples，每次96 samples，共可進行5次實驗。

e. 若是人類樣品，使用者可選擇提供Sequence, RS Number, Region or Gene等資訊，交由核心實驗室設計；樣品若為其他物種，請提供SNP位點及其前後至少60 bp 序列資料。
同一Assay之中，50 bp以內盡量不要有其他SNP位點。

聯絡資訊

蔡孟勳 副教授 02-3366-6009 motiont@ntu.edu.tw